神经内分泌肿瘤具有特殊血清标记物系统，即嗜铬蛋白A。嗜铬蛋白A是神经内分泌肿瘤细胞分泌颗粒里蛋白，会随着肿瘤分泌激素一起释放入血，所以患者可以前往医院做嗜铬蛋白A标记物检查。

　　另外，针对分泌不同激素神经内分泌肿瘤，分泌特定激素也是其特定标记物，比如胃泌素瘤病人就可以检查血清胃泌素来协助诊断；胰岛素瘤病人就可以查血清胰岛素来协助诊断。

　　除此之外，消化道肿瘤标记物，比如CEA或是甲胎蛋白，这些消化肿瘤标记物在神经内分泌肿瘤里面诊断意义不是很大，但是如果出现这些标记物升高，往往提示病人预后不好。