第一、发病机理不同，脑梗是急性梗死的动脉因为局部的血管本身存在狭窄等病变继发血栓形成引起的，动脉粥样硬化是本病的根本原因。脑栓塞形成是脑梗死的动脉本身有或没有明显的病变，是血液当中的栓子堵塞了动脉所致。

　　第二、病因不同，脑血栓形成病因是动脉粥样硬化、动脉炎、药源性的疾病、血液系统的疾病，心源性疾病有心房颤动、心脏瓣膜病、心肌梗死、手术介入等。脑梗一般是安静状态下发病的多，栓塞一般是活动中急速发病。

　　第三、病情进展的不同，脑梗死一般是缓慢的进展，10余小时到2到3天达高峰。栓塞数秒到数分钟病情达高峰。脑梗死一般系老年人患病的多，脑栓塞一般是青年人患病比较多。

　　第四、基础疾病不同，脑梗死是有动脉粥样硬化性的疾病，如动脉炎。脑梗塞一般是风湿性心脏病、冠心病、严重的心律失常、有心脏手术、长骨骨折、血管内介入手术治疗，脑栓塞发生时，同时也会引起肺栓塞、肾栓塞，皮肤栓塞等。