急性细菌性结膜炎一般选择抗生素滴眼剂，常用的眼药有托百士，氧氟沙星等，不配合点药儿童则选择眼膏。

　　严重的细菌性感染如伴随有角膜炎，短期3-5天口服抗生素治疗同时加用玻璃酸钠滴眼液修复角膜上皮。如果是病毒感染，可用利巴韦林、更昔洛韦眼药、干扰素滴眼液或者眼用凝胶治疗，同时口服抗病毒口服液。

　　病毒感染多数会引起角膜炎，因此早期使用玻璃酸钠滴眼液就很有必要。各类型结膜炎波及角膜引起角膜炎时应按角膜炎治疗原则处理。确定致病菌属后给予敏感抗生素滴眼液、必要时联合抗病毒滴眼液。

　　切勿包扎患眼、眼睛热敷，但可配戴太阳镜以减少光线的刺激。合并全身症状者同时需要全身用药治疗。