秋季腹泻一般起病急，初期常伴有感冒症状，如咳嗽、鼻塞、流涕，绝大多数患儿还会发热，一般为低热，很少高热。半数患儿会出现呕吐。早期呕吐先于腹泻，频繁呕吐，吐出胃内容物和奶汁，呕吐持续2-3天。随后24小时内开始出现腹泻，宝宝的大便次数增多，每日10次左右，大于3次就应考虑秋季腹泻，大便稀薄，呈乳白色、黄色或绿色蛋花汤样，偶尔带少许黏液或脓血，无特殊腥臭味；腹泻的时间可持续约3-5天或1周，少数可长达3周。