首先对于确诊为肛瘘的患者，不主张采用药物治疗。因为肛瘘一旦确诊，建议早期进行手术治疗。如果使用药物治疗，那么有可能耽误病情，使一些单纯性的肛瘘演变为复杂性肛瘘，从而增加手术的难度和加重病情，那样会导致组织器官和功能损伤进一步加重。所以在肛瘘用药方面不推荐。但是，对于肛瘘手术后的患者，可以采用一些药物作为辅助治疗，可以促进伤口的愈合，比如肛泰膏、马应龙麝香痔疮膏等都可以选用。