因为巨脑回畸形目前认为其发病原因可能是与宫内感染、缺氧、中毒、外伤、接触放射线等损害有一定关系。

所以在预防方面一定要避免宫内感染、缺氧、中毒、外伤、接触放射线等损害，所以如果存在了相应的危险因素，那么需要积极的进行产前的筛查，因为对于该疾病一旦发生，其预后不会太好，因为该疾病不管是采用哪种治疗方式，预后都不会让人满意。

因为该疾病如果早期通过手术，有可能会使癫痫的症状得到较好控制，但是术后患者智力的发育得不到改善，所以关键在于做好孕期保健及产前诊断工作，避免巨脑回畸形儿的出生。