首先这种人毛滴虫与阴道毛滴虫形态相似，但波动膜和肌染色干较长直至重启后端，后边在波动膜左侧并行。在虫体后端伸出体外，伪足形成较少见，在不适宜环境中可形成假包囊。虫体通过吞饮吞噬等获取营养。滋养体寄生在人结肠，并以纵二分裂法繁殖。滋养体随腹泻以及大便排出，在室温下可存活8天，土壤中可存活7天，人因食入被滋养体污染的食物或者是饮水而感染，也可由苍蝇等传播。

它的发病机制有人毛滴虫可引起肠粘膜充血、水肿和炎症反应，粘膜上皮细胞坏死、倒脱落淋巴滤泡、小囊肿形成，当宿主抵抗力下降时，在肠道共生细菌的存在下，虫体大量繁殖粘膜损害明显加重，腹泻次数增多，毛滴虫的活跃运动造成强烈的机械刺激，引起腺体分泌亢进，虫体具有较多的溶酶体内含丰富的酸性磷酸酶等水解酶，大量重体释放的溶酶体内可使肠粘膜上皮细胞变性坏死出现腹泻。这种都是长毛滴虫病的病因。

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