肝囊肿的治疗主要是以药物治疗以及手术治疗为主。

　　例如，一般单纯性的囊肿无需用药，多囊性肝病的患者，可选用熊去氧胆酸、托伐普坦等药物来进行治疗；肝包虫病，则可以使用甲苯达唑、阿苯达唑等抗包虫病类的药物进行治疗，长期应用可起到抑制病灶发展的作用。

　　对于药物效果不佳，或者是病情本身就比较严重的患者而言，需要进一步来医院进行手术治疗，单纯性肝囊肿可选择外科手术，也可以选择经皮穿刺手术；多囊性肝病，可以选择抽吸术、开窗术、切除术；肝包虫病可以选择经皮细针穿刺引囊术、外科手术等。