通常制肉苁蓉是指炮制后的肉苁蓉，包括酒苁蓉、盐苁蓉等，而生肉苁蓉是指生苁蓉，两者主要是制作方法、功效等方面存在区别，具体如下：

　　1、制作方式

　　生苁蓉一般无需特殊炮制，可以直接入药。酒苁蓉一般是取肉苁蓉片加入黄酒装在密封的容器内进行隔水加热或者是蒸汽蒸馏，当其表面呈黑色时取出、干燥即可使用。盐苁蓉是将肉苁蓉片在盐水中浸泡一段时间再取出晒干，作为药用。

　　2、功效

　　生苁蓉和酒苁蓉、盐苁蓉都具有补肾止浊、润肠通便等功效，但是生苁蓉润肠通便的作用略强于酒苁蓉和盐苁蓉，多用于治疗肠燥便秘、白浊等病症;而酒苁蓉补肾助阳的作用强于生苁蓉和盐苁蓉，多用于治疗肾阳虚引起的腰疼、遗精、不孕等病症;盐苁蓉功效略温和，作用处于酒苁蓉和生苁蓉之间，但是盐苁蓉含有的钠、钾、碘等微量元素高于其他两种药物。