引起肾盂肾炎的细菌种类与感染的方式相关，主要是革兰氏阴性菌，尤其是大肠埃希菌最常见，具体有以下几种情况：

　　一、逆行感染。以革兰氏阴性菌为主，大部分为大肠杆菌。

　　二、血行感染。为金黄色葡萄球菌、沙门菌、铜绿假单胞和念珠菌。

　　血行感染是肾盂肾炎的主要来源感染，是肾脏部位发生损害或长期使用免疫抑制剂以及患有慢性消耗性疾病以及糖尿病，免疫能力下降时可使血流入侵到肾脏。