激光治疗扁平疣是否留有疤痕，需要根据治疗时有无对真皮组织产生损伤判断。因为扁平疣是由病毒感染引起的病毒性疣，只是侵犯表皮组织，大多数人经过激光治疗后不会留疤。

　　部分患者治疗后可能会出现色素沉着，但经过一段时间后会恢复正常。只有极少数患者在做激光治疗时，如果损伤真皮组织可能会留下疤痕。