半夜肛门瘙痒考虑是肠道寄生虫感染、肛门瘙痒症引起。如果肠道内感染寄生虫，在半夜时寄生虫爬出肛门，且在肛门部位活动、产卵，从而引起肛门瘙痒；此时需化验大便常规，才能明确诊断。

　　除此以外，还有可能是肛门瘙痒症引起。肛门瘙痒症是一种常见的皮肤病，患者表现为夜晚时肛门瘙痒剧烈。