早上起来后脑勺疼主要有以下几种原因：

　　一、夜晚睡觉时头部受凉或睡觉姿势不当以及枕头过高，导致局部血液流通不畅以及后脑勺疼痛，建议活动颈部肌肉或热敷。

　　二、颈椎病，建议到医院做颈椎CT确定病变，采取进一步措施。

　　三、颅内感染，比较严重，需要做颅脑的相关检查，及时在医生指导下做进一步处理。