新生儿进行两病筛查主要筛查先天性遗传类疾病,常见先天遗传代谢类疾病,如苯丙酮尿症或者是甲状腺发育不良等疾病,在进行检查时候主要选择在新生儿出生之后三到七天之内,尽量到三级以上儿童医院进行检查。如果发现先天性代谢性疾病会影响到新生儿身体健康发育,需要及时接受治疗,检查方法是采足底血。