空囊没有卵黄囊一般与胚胎染色体异常有关系。在怀孕早期，胚胎染色体异常是导致胚胎不发育常见原因。母亲患有全身性疾病，比如严重贫血、心力衰竭、严重感染、慢性消化性疾病、慢性肝病或者高血压等也会导致胚胎停止发育。

　　体内激素水平分泌异常，比如患有黄体功能不全、高泌乳素血症、多囊卵巢综合征、甲状腺功能减退、糖尿病血糖控制不良也会导致空囊情况发生。