怀孕41天可以选择药物流产，药物流产主要适合于平均怀孕35~49天暂时没有生育要求的女性。

　　在服药之前需要进行超声检查，确定是正常的宫内妊娠，并且同时没有肝肾疾病或者是青光眼、哮喘等服药禁忌症，在医生的指导下才可以服药，不推荐自行服药，并且在药流以后一周需要去医院复查超声，了解宫内是否有残留。