怀孕41天需要到医院做B超，确诊为宫内妊娠。同时，做好术前检查，没有禁忌症可以行人工流产手术。

　　人工流产手术的适合时间为怀孕六到十周。如果胚胎过小，易出现漏吸的情况；如果过大，可能导致手术时间延长、流血量过多、术后恢复慢。

　　所以在怀孕41天，可以做人流手术。在手术前三天不能同房，手术后注意休息，一个月以内不能同房，同时要加强营养。