怀孕三个月肚子疼原因：

　　第一、先兆流产引起腹痛，需要保胎处理。

　　第二、个别三个月还没有行超声检查，需要排除异常妊娠，甚至葡萄胎引起肚子疼痛。建议在怀孕初期就要到医院行超声检查，要确认宫内孕。

　　第三、泌尿系统疾病、胃肠炎、阑尾炎等疾病引起肚子疼痛。怀孕后三个月出现肚子疼，要根据不同原因予以不同处理。