奥美拉唑的不良反应可能会出现头痛、胃肠道的症状，比如会出现便秘、恶心等，还可能会出现头晕、嗜睡、乏力、感觉异常，也有少部分患者可能会出现过敏，出现皮疹、瘙痒以及荨麻疹的症状。严重的患者还可能会出现肝功能的异常，表现为肝脏的转氨酶升高，也可能会导致患者出现白细胞减少、血小板减少、粒细胞缺乏等。