胃肠道间质瘤活检，从理论角度有一定扩散和转移风险。胃肠道间质瘤不像胃癌和肠癌，一定要在术前获得明确病理诊断才能进行手术治疗。

　　胃肠道间质瘤如果经过术前影像学判定，可以直接进行手术根治性治疗。如果进行CT或者彩超引导下穿刺活检，肿瘤组织有可能破裂，有潜在引起肿瘤复发以及转移风险。

　　部分患者如果术前进行靶向治疗，需要明确病理或者肿瘤相对巨大，侵犯到邻近脏器，需要进行新辅助治疗，可以选择术前病理活检，才能获得明确的病理诊断，给予分子靶向治疗。