孩子矮小的原因有遗传因素、体质因素、营养的关系、全身有疾病的影响，还有一些社会的心理问题。但是最重要的还是内分泌导致的身材矮小，最常见的有生长激素的缺乏这一大类是最常见的。

　　还有一些是先天性的甲状腺功能减低症，还有就是特纳氏综合征。还有一些是由于先天性的遗传代谢性的因素所导致的，比方肾上腺皮质增生症。还有一些是性早熟、粘多糖症、皮质醇增多症，这些病都可以出现矮小，所以要根据病因来进行治疗。