胃蛋白酶原1是由胃底主细胞和壁细胞分泌的。当胃蛋白酶原1增高时，都提示胃黏膜分泌功能增强。胃粘膜损伤严重，糜烂以及消化性溃疡的风险增加。

　　而当胃蛋白酶原1降低时，提示胃黏膜分泌功能下降，胃黏膜萎缩肠，上皮化生以及不典型增生的风险增加。

　　此外还可以通过胃蛋白酶原1和胃蛋白酶原2比值，进一步判断胃黏膜的情况。当其比值下降时，应高度怀疑是否存在胃癌。