细菌和病毒发烧的区别在于临床症状是不同的。病毒性呼吸道感染时患者伴有全身的肌肉酸软乏力和上呼吸的卡他症状为主，无明显的脓性分泌物的出现，例如无咳脓痰以及流脓鼻涕等现象。

　　而细菌感染引起者多伴有不同程度的畏寒、高热等现象，还可以出现咳脓痰、流脓鼻涕等症状。此时行相应的化验检查，病毒感染白细胞、中性粒细胞比基本是在正常的，C反应蛋白以及降钙素原也可以是正常的。

　　而细菌感染时，上述的炎症指标多有不同程度的升高。最后治疗上有不同，细菌感染者多需要予以有效的抗生素抗感染治疗。而病毒感染患者抗生素治疗是无效的，多需要加强支持对症的处理。