连续吃20天阿莫西林可能会刺激肠胃道、过敏、药物耐药等，在用药治疗期间要谨遵医嘱。

1、刺激肠胃道：连续吃阿莫西林在吸收和消化道的过程中，药物成分会刺激肠胃黏膜，可能会导致肠胃道的吸收和消化能力受到影响，容易伴有恶心、呕吐、食欲下降等危害。

2、过敏：连续吃20天的阿莫西林可能会诱发过敏几率增加，比如出现过敏性皮炎或者过敏性荨麻疹。

3、药物耐药性：连续吃20天的阿莫西林，长时间的服用药物，可能会产生药物的耐药性，从而会导致药物的治疗效果减弱或者消失。

建议在用药一疗程以后要做复查，配合医生调整用药剂量。