新生儿血氧低原因有窒息、新生儿肺炎、先天性心脏病等，治疗与原因有关。

1、窒息：出生时缺氧导致肺通气功能障碍，见于难产时，需及时进行新生儿窒息复苏，比如畅通呼吸道、球囊正压通气，甚至进行胸外按压、使用肾上腺素等。

2、新生儿肺炎：肺部受到致病菌入侵导致肺通气换气功能障碍，会有呼吸困难、咳嗽、吐沫、气促等，建议吸氧、抗感染治疗。若吸氧不能维持血氧，还需要呼吸机辅助呼吸。

3、先天性心脏病：比如：房间隔缺损、室间隔缺损比较严重时，导致低氧血症，会有心率增快、心力衰竭等，建议进行心脏超声检查明确，症状明显时，需及时进行介入手术治疗。

此外，还需要警惕先天性肺发育不良、脑发育不良等。