肛瘘的早期症状是在原来肛周脓肿破溃处又逐步肿胀、发红、跳痛，最终在原处破溃流出脓液，以后不断排出脓性分泌物，有时外口又闭合 ，反复发作。

　　如果分泌物排出通畅，患者多不感觉疼痛。由于脓液不断刺激肛周皮肤，常感觉瘙痒、肛周潮湿不适、皮肤变色、表皮脱落、纤维组织增生和增厚，有时形成湿疹。