乳腺癌内分泌治疗的缺点主要是治疗上有一定局限性。一般需要根据患者的激素水平进行选择，如果患者的激素水平均为阴性，是不能进行内分泌治疗的，这就是内分泌治疗的主要缺点之一。

如果患者ER受体即雌激素受体、PR受体即孕激素受体阳性，可以选择内分泌治疗，而且非常有效。目前内分泌治疗的药物主要包括他莫昔芬；芳香化酶抑制剂，如来曲唑、阿那曲唑；抑制激素，比如说甲地孕酮等药物进行治疗。

内分泌治疗的主要优点是相对来说，毒副作用小、耐受性强、效果好，缺点主要是疗程比较长，而且是一定需要受体阳性的人才可以使用。有一定的选择性，也有一定的局限性。