手上起小水疱有多种原因，要根据病因进行针对性的治疗。

第一种一些病毒感染可引起手上起小水疱，比如像手足口病、水痘、手部的单纯疱疹。这个要治疗原发疾病，主要是抗病毒治疗，局部的水疱可以外用抗病毒的药膏，比如阿昔洛韦、干扰素等进行治疗。

第二种手上起小水疱，它主要是由于手部的过敏、湿疹，特别是汗疱疹能所引起来的，往往伴有明显的瘙痒。那么治疗上通常是给予抗过敏的糖皮质激素药膏，比如像卤米松软膏、艾洛松软膏等进行治疗。

第三种比较常见的这种手上起小水疱，它是由于手部的真菌感染引起来的，首选要使用抗真菌药物，比如美克、达克宁等等进行治疗，才会好转。