引起子宫肌瘤的确切病因尚未阐明，可能与遗传和性激素水平等因素有关。

子宫肌瘤可能与患者的体内性激素分泌旺盛有关，同时肌瘤组织中雌激素受体浓度明显高于周边组织，所以认为肌瘤组织对雌激素的高敏感性是主要原因。还有孕激素也能刺激肌瘤细胞的有丝分裂，从而刺激肌瘤的生长。在孕期，雌孕激素是高分泌的，常常会导致肌瘤的生长。绝经之后雌孕激素水平是降低的，常常会导致肌瘤的缩小，甚至消退。

同时子宫肌瘤的发病还与遗传因素有关，如果女性的母亲或者姐妹患有子宫肌瘤，该女性患肌瘤的机率是相对较高的。