单纯疱疹病毒Ⅰ型和Ⅱ型的区别：抗原性不同，DNA即核酸结构、基因结构不同，好发部位不同。

第一、结构不同，Ⅰ型和Ⅱ型单纯疱疹病毒是因为抗原性不同而分成的两个型别。第二、DNA即核酸结构、基因结构不同，大概有50%的同源性，另外一部分各不相同。第三、两型单纯疱疹病毒引起的单纯疱疹好发部位不同。Ⅰ型单纯疱疹病毒主要引起生殖器部位以外其他皮肤上面的单纯疱疹，比较常见的如口唇、口周，或者其他部位皮肤上的一些单纯疱疹。而Ⅱ型单纯疱疹病毒主要是引起生殖器部位的生殖器疱疹，属于一种性传播疾病。也有少数Ⅰ型单纯疱疹病毒，如果接触到生殖器部位，也可以引起生殖器疱疹。