脑囊肿和脑肿瘤在影像学上有一定的区别，囊肿在CT上是低密度灶，而脑肿瘤一般是中高密度灶。

在临床上，脑肿瘤分为良性和恶性。良性肿瘤病情进展比较慢，对患者影响也比较小，常常给予手术切除，可以达到治愈。而恶性肿瘤往往需要扩大切除甚至需要辅助放化疗，才能取得比较好的治疗效果。而脑部的囊肿，如果是蛛网膜囊肿，比较小，也没有症状，可以观察。如果是恶性肿瘤继发的脑部的囊肿，也需要行积极的手术的切除。根据肿瘤的恶性程度，辅助放疗、化疗。而寄生虫造成的囊肿，根据寄生虫所在的部位，可能需要行手术明确诊断，继而辅以抗寄生虫的药物治疗。