胃蛋白酶原浓度下降，以及胃蛋白酶原一和胃蛋白酶原二的比值下降，对于萎缩性胃炎有提示作用，可用于早期胃癌的筛查；因此，胃蛋白酶原偏高是没有意义的。

胃蛋白酶是胃黏膜分泌的消化酶类，除了胃黏膜分泌以外，在口腔以及其他组织器官也会分泌类似的胃蛋白酶。在胃内胃蛋白酶原分为两个类型，分别为胃蛋白酶原一和胃蛋白酶原二，在不同的疾病或者是胃黏膜不同的状态下，例如炎症萎缩以及肠上皮化生、不典型增生甚至癌变时，胃黏膜分泌胃蛋白酶原一，或者是胃蛋白酶原二的含量是不一样的，会出现胃蛋白酶原检测数值的变化。