胃蛋白酶原和胃癌没有直接的关系。它主要是由泌酸腺主细胞合成，在胃腔内经过盐酸或者有活性的胃蛋白酶作用变成胃蛋白酶。胃蛋白酶原由主细胞合成，并且以不具有活性的酶原的颗粒形式储存在细胞内。当细胞内充满酶原颗粒时，对新的酶原的产生具有负反馈的作用，分泌进入胃腔内的胃蛋白酶原，在胃酸的作用下从分子中分离出小的分子多肽，转变为具有活性的胃蛋白酶，已激活的胃蛋白酶原对胃蛋白酶也有激活作用，主要是消化作用。

目前没有发现胃蛋白酶原和胃癌有一定的关系，胃癌是来源于胃黏膜上皮细胞的恶性肿瘤，是一种恶性程度相对也比较高的恶性肿瘤。