亚急性甲状腺炎的治疗分为一般治疗、特殊治疗等，一般治疗就是要注意休息，保持情绪稳定。如果合并有发热的患者要采用物理或药物降温。特殊治疗包括局部的镇痛，因为患者经常会合并局部的疼痛，可以给予消炎止痛治疗。

　　如果患者疼痛明显，伴有发热可给予糖皮质激素治疗。对于亚甲炎引起的甲亢，在应用上述治疗同时可加用β受体阻滞剂。针对于亚甲炎引起的甲减的治疗，一般为一过性的甲减，如果症状明显者可以适当的给予小剂量的甲状腺激素替代治疗，症状好转，逐渐减量直至停用。