自然流产的大多数原因是由于胚胎染色体异常，约占自然流产因素里的50~60%，也有母体因素、父亲因素以及环境因素等。

　　对于母体因素常见于孕妇患有全身性的疾病，比如严重的感染、高热疾病，心力衰竭、肝肾功能疾病以及高血压等，还有母亲有生殖道的畸形、内分泌功能异常、免疫功能异常等都可以导致流产。

　　而对于父亲的因素，比如精子畸形率高，也可以导致自然流产。环境因素，比如孕妇接触过多的放射线以及有毒的化学物质，也可以导致流产。