肛瘘主要临床表现为肛门周围外面有外口，外口里面会有粪便或是粪水分泌物、脓液流出。

　　同时，肛瘘患者可以自己摸到肛门周围窦道、管道或是包块、硬结等各种表现，如果在急性期，可能还会有疼痛、发烧、发热、高烧，局部有流脓水等表现。

　　如果肛瘘比较严重，还有可能会引起便秘、流血、出血等表现，更严重时会堵塞肛门直肠，引起大便不容易解出等情况发生。

　　极少数肛瘘会出现癌变情况，即和肿瘤表现相近似，比如肛门肿块、便血、脱出等。