在临床上肛瘘是存在一定的复发概率的，其复发概率的高低跟肛瘘的严重程度以及手术情况有直接的关系。如果是低位单纯性肛瘘，一般采取肛瘘切除术后是不会存在复发的。但是如果是高位复杂性肛瘘，由于瘘管相对比较多，其手术处理难度较大，所以后期存在一定的复发概率。

　　尤其是多次采取肛瘘手术治疗的患者，由于瘘管以及疤痕很难完全处理干净，这样的话也存在一定的复发概率。