术后认知功能障碍和术后谵妄的区别如下：

1、发病时间：术后认知功能障碍多在手术两周后出现，术后谵妄多在术后1-3天内出现。

2、病程：术后认知功能障碍病程较长，可维持数周或数月，而术后谵妄患者病程一般较短，多在数天或数周内缓解。

3、症状：术后认知功能障碍的患者主要表现为记忆力、注意力下降，术后谵妄患者主要表现为认知能力障碍、情绪改变。

4、治疗：术后认知功能障碍治疗周期长，部分较为严重的患者不可逆，术后谵妄通常是可逆的，治疗周期也比较短。