孕酮低通常不会导致胎儿畸形，但可能会引起流产。

　　孕酮是卵巢黄体分泌的一种天然孕激素，在女性怀孕过程中，孕酮可以刺激子宫变化，并通过增加生殖系统血管和组织的血流，促进胚胎发育。如果怀孕期间孕酮比较低，可能会导致胎儿发育迟缓，也会导致子宫得不到相应的刺激，使子宫变得比较敏感，外界稍微一些刺激就有可能会引发宫缩，从而流产。但是，孕酮低通常不会导致胎儿畸形。

　　胎儿畸形目前临床认为与染色体异常、基因异常、感染、辐射等因素有关，如果想要预防胎儿畸形，孕期应做好相关检查，包括对胎儿染色体异常的筛查和针对胎儿畸形筛查的超声检查，其中以21-三体综合征为代表的染色体异常为产前筛查的重点。