真性红细胞增多症患者由于血液粘稠度的增加，血栓的发生率要远高于正常人，可能会发生动脉血栓、心肌梗死以及脑梗死。也可能会出现静脉血栓，包括下肢深静脉血栓、罕见部位的静脉血栓、门静脉血栓或者是脑部的静脉窦血栓。还可能会出现微血管血栓，包括红斑肢痛、手指末端疼痛。

　　真性红细胞增多症的患者在治疗方面，主要是根据患者的血栓风险程度给予预防血栓以及降细胞治疗。