因为巴雷特食管是胃食管反流病并发症，通常都需要治疗。

　　针对巴雷特食管，首先是治疗反流性食管炎，即通过改变生活方式及应用质子泵抑制剂药物治疗，同时定期复查内镜，监测巴雷特食管。

　　因为巴雷特食管是食管腺癌的高发因素之一，一旦发现合并有腺上皮不典型增生，病人可通过内镜下行切除处理，一旦发现巴雷特食管引起进展期腺癌或食管腺癌，则可以通过手术方式治疗。