绝大部分心肌炎是由病毒感染所致。在病毒感染的人群中，心脏受累者为百分之二到五。目前已知几乎所有的人类病毒感染均可累及心脏，引起病毒性心肌炎。其中肠道病毒最为常见，而肠道病毒中又以柯萨奇B组病毒占大部分，人类腺病毒也被认为可能是重要病毒之一。巨细胞病毒、疱疹病毒、EB病毒。流感和副流感病毒、微小病毒，及腮腺炎病毒也占少量比例。有学者报道，丙型肝炎病毒感染在心肌疾病中也起重要作用。