支气管镜检查后的副作用有出血以及气胸的反应，也可能会造成发热和过敏性的休克。在做支气管镜检查的过程中，需要注射麻醉类的药物，有部分的人群可能会对这种麻醉类的药物产生过敏反应，通常会表现为头晕头痛和嗜睡，也可能会造成过敏性的休克严重，严重的还会引起生命危险。有一部分的人群在做完支气管镜检查之后，还会有局部出血和气胸等反应。在做完治疗之后要密切的关注是否出现了不良反应，及时采取针对性的治疗措施来改善。