手术方式有多种，如甲状腺全切术，把甲状腺全部切除，有可能会损伤神经组织。患者术后需要长期用药。另外还有甲状腺叶切除术，通常切除一侧甲状腺组织，这种切除损伤和风险性都比较小，恢复起来是比较快的，另外并发症相对也很少，适合早期恶变患者，适合大部分良性肿瘤。另外还有近年兴起的微波消融术，是针对甲状腺良性结节的一种微创手术。