肩膀上的两块肌肉疼痛，可能为三角肌、肱三头肌、斜方肌等，主要原因可能有肌肉劳损、肌肉拉伤等原因，应根据不同原因行不同的处理方式，如卧床休息，调整生活习惯、物理疗法、药物止痛等方式治疗。

1、卧床休息：如果为简单的肌肉劳损、拉伤，此为运动后正常的生理反应，常出现在运动后，表现为肩膀整块肌肉酸胀疼痛，可通过卧床休息缓解疼痛，待乳酸代谢完毕，肌肉拉伤愈合后，肩部肌肉疼痛即可消失，通常疼痛可在一周内缓解。

2、调整生活习惯：如果患者日常生活中长时间伏案、坐姿不当等，也会造成肌肉劳损，患者可通过调整生活习惯，改变日常坐姿、卧姿，来缓解肩部肌肉疼痛。

3、物理疗法：患者可通过物理疗法减轻疼痛，如热毛巾湿敷，可通过加快血液流动加快好转，也可通过按摩、烤电等方式减轻肩部肌肉疼痛。

4、药物止痛：如果患者如疼痛严重，休息及物理疗法不缓解，还可使用止痛药物如：乙水杨胺、对乙酰氨基酚、布洛芬等在医生嘱托下服用，对症止痛治疗。