半夜醒来脑子特别清醒可能是睡前喝咖啡或浓茶、精神压力大、抑郁症等因素引起，需要根据不同的原因进行不同的处理。具体如下：

1、睡前喝咖啡或浓茶：睡前喝咖啡或浓茶可能导致半夜醒来脑子特别清醒，因为咖啡和浓茶中含有咖啡因，具有提神的作用，可以刺激中枢神经兴奋。建议避免在睡前饮用此类饮品，这种情况一般能够自行缓解。

2、精神压力大：精神压力大也会导致睡眠障碍，当长期精神压力大会影响人的神经功能并导致自主神经功能障碍，可表现为入睡困难，睡着之后易醒，并且脑子特别清醒 。建议调整自己的情绪，适当参加有氧运动；可以参加更多的集体活动，与朋友多交流，缓解精神压力。

3、抑郁症：抑郁症是一种心理疾病，与遗传、心理因素等因素有关。患者的核心症状是心境低落、兴趣减退、快感缺失，可以伴有睡眠障碍的表现，如入睡困难、睡眠轻、早醒等，早醒是最具特点的，患者通常在半夜醒来，比平时早2-3个小时起床，醒来后脑子特别清醒，就再也睡不着了。可在医生的指导下使用氟西汀、舍曲林、帕罗西汀等抗抑郁药物，还需要进行心理治疗，包括支持性心理治疗、认知行为治疗等。