目前对于肠胃功能紊乱无特效药物，主要是经验性的治疗。可以选择抑制胃酸的药物或者缓解上腹痛、上腹灼热感和促胃肠动力的药物，如莫沙必利、伊托必利、吗丁啉等，缓解餐后腹胀、早饱的症状。还可用消化酶制剂治疗与进餐相关的上腹胀、食欲差等。肠易激综合征的治疗目的是消除患者顾虑，改善症状，提高生活质量。治疗策略主要是积极寻找并去除发病因素和对症治疗，强调个体化治疗和综合治疗的原则。可以选择一些解痉止痛药、止泻药、肠道微生态制剂和抗抑郁药等。

肠胃功能紊乱的治疗，主要是要遵循综合治疗和个体化治疗的原则。要帮助患者认识和理解病情，建立良好的生活和饮食习惯，避免烟酒及服用非甾体类抗炎药，避免食用可能诱发症状的食物。注意根据患者不同特点进行心理治疗，比如失眠焦虑者可适当服用镇静或抗焦虑药物。