三个月宝宝咳嗽有痰，首先考虑呼吸道感染，像咽喉炎、气管炎或肺炎。引起宝宝呼吸道感染常见的病菌有细菌、病毒、支原体，如果是细菌感染引起的，可以给予抗生素治疗。如果是病毒感染引起的，病毒感染当中除了流感病毒有针对性的药物奥司他韦以外，其他的病毒没有特效药，只能予以对症治疗。如果是支原体感染引起的，可以给予抗支原体的药物，宝宝常用的是大环内脂类当中的阿奇霉素。

另外宝宝咳嗽有痰可以给予对症治疗，可以给予一些止咳化痰的药物口服，也可以给予普米克令舒加可必特雾化吸入，痰多的可以给予化痰的药物，像氨溴索或者乙酰半胱氨酸。