肠易激综合征和克罗恩病的区别包括疾病性质、肠镜检查、药物治疗等方面：

第一，肠易激综合征是一种功能性疾病；克罗恩病是一种器质性疾病。第二，肠易激综合征患者的肠镜检查可以提示肠黏膜是正常；克罗恩病患者的电子肠镜检查可以看到回肠末端和附近的结肠有深在的裂隙样溃疡，病理检查常提示非干酪性肉芽肿性炎症性改变。第三，肠易激综合征患者需要使用肠道的双向调节药物以及益生菌进行治疗，例如马来酸曲美布汀以及地衣芽孢杆菌等；克罗恩病则是需要美沙拉嗪等药物进行治疗，必要时还需要加用糖皮质激素或者是免疫抑制剂、单克隆抗体等药物进行治疗。