一般情况下，新生儿房间隔缺损二级可能是先天发育畸形、基因突变、母体感染等因素引起的。具体分析如下：

　　1、先天发育畸形：如果发育过程中出现异常，例如心脏分割不完全或心脏结构异常，就可能导致房间隔缺损的形成。

　　2、基因突变：某些基因突变与心脏发育相关的基因突变，如NKX2.5、TBX5等，已被发现与房间隔缺损有关。这些基因突变可能影响心脏的正常发育和房间隔的形成，导致缺损的发生。

　　3、母体感染：母体在妊娠早期不注意防护，可能会感染巨细胞病毒、风疹病毒等病毒，影响胚胎的正常发育过程，导致心脏结构出现缺陷。

　　除以上三种原因外，还可能是其他原因引起的，如接受过多辐射、胎儿宫内缺氧、妊娠期糖尿病等，建议患者及时就医治疗。如果出现了新生儿房间隔缺损二级，建议前往正规医院通过房间隔缺损修补术进行治疗，同时加强护理，注意保养。